Η προέλευση και η εξάπλωση των επιδημιών

ΚΩΔΙΚΟΣ: BEE705

  • Διδάσκοντες
Χάλλεϋ Τζων – Μάξγουελ
(Καθηγητής)
  • Θεωρία: 2 ώρες/εβδομάδα
  • Εργαστήριο: 1 ώρες/εβδομάδα
  • Πιστωτικές μονάδες (ECTS): 3
  • Διδακτικές μονάδες: 3
  • Μέγιστος αριθμός φοιτητών: 30
  • Εβδομαδιαίες ώρες διδασκαλίας: 3
Γλώσσα/ες διδασκαλίας:
Αγγλικά
ERASMUS: Προσφέρεται για ERASMUS
Τρόπος παράδοσης: Πρόσωπο με πρόσωπο
Χρήση Τ.Π.Ε.:
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στη Διδασκαλία
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Εργαστηριακή Εκπαίδευση
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Επικοινωνία με τους φοιτητές

Περιεχόμενα μαθήματος

  • Θεωρία μαθήματος

Οι επιδημίες από την οικολογική, εξελικτική και πληθυσμιακή προοπτική.

  • O ρόλος της νόσου στα φυσικά οικοσυστήματα
  • Το εξελικτικό πλαίσιο της νόσου
  • Τα μικροπαράσιτα της νόσου. Ο ρόλος των ζωικών φορέων στη μετάδοση μολυσματικών ασθενειών.
  • Περιπτωσιολογικές μελέτες επιδημιών και πληγών στην αρχαία και τη σύγχρονη ιστορία: πανώλη των βουβωνικών, ισπανική γρίπη, γρίπη του Χονγκ Κονγκ, SARS, AIDS, COVID-19
  • Το μοντέλο SIR – 1: Δυναμική μιας μολυσματικής ασθένειας
  • Το μοντέλο SIR – 2: Κατανόηση και εκτίμηση της παραμέτρου “R0”
  • Το μοντέλο SIR – 3: Εκτίμηση παραμέτρων επιδημίας
  • Χωρικά μοντέλα επιδημιών
  • Πρόβλεψη μελλοντικών εστιών: οι δεξαμενές μόλυνσης σε άγρια ζώα, σε αγορές ζωών και σε κτηνοτροφικές μονάδες
  • Τεχνικές ελέγχου: καραντίνες, ανοσία αγέλης, μερικός εμβολιασμός
  • Εργαστηριακές ασκήσεις
  • Εισαγωγή στο περιβάλλον προγραμματισμού R
  • R πακέτα για επιδημιολογία: «epimdr», «outbreaks» κλπ.
  • Προσομοιώσεις της δυναμικής του μοντέλου SIR
  • Προσομοιώσεις της δυναμικής του χωρικού μοντέλου SIR
  • Εφαρμογή μοντέλων σε πραγματικά δεδομένα

Μαθησιακά αποτελέσματα

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος, οι φοιτητές:

  • κατανοούν τις επιδημίες με την οικολογική και εξελικτική προσέγγιση
  • ερμηνεύουν επιδημιολογικά δεδομένα
  • κατασκευάζουν μοντέλα επιδημιών
  • εφαρμογή στατιστικών μοντέλων σε επιδημιολογικά δεδομένα

Γενικές ικανότητες

  • Εφαρμογή της γνώσης στην πράξη
  • Αναλύστε τα επιδημιολογικά προβλήματα χρησιμοποιώντας εξελικτικές / οικολογικές προσεγγίσεις

Οργάνωση διδασκαλίας

  • Διαλέξεις: 26
  • Εργαστηριακές ασκήσεις: 15
  • Φροντιστήριο: 15
  • Ανάλυση επιστημονικών άρθρων: 18
  • Δραστηριότητες σε Η/Υ: 9

Σύνολο Μαθήματος: 83

Αξιολόγηση φοιτητών

Γραπτή Εξέταση σε θέματα γνώσης και κρίσης, απόδοση στις συνθετικές εργασίες, γενική εκτίμηση της ικανότητας και του ενδιαφέροντος του φοιτητή.

Μέθοδοι Αξιολόγησης Φοιτητών

  • Γραπτή Εξέταση (Συμπερασματική)
  • Γραπτές εργασίες

Συνιστώμενη βιβλιογραφία

  • Vynnycky, Emilia, and Richard White. An introduction to infectious disease modelling. OUP oxford, 2010.
  • Bjørnstad, Ottar N. "Epidemics." Models and data using R. Springer International Publishing, 2018.