Διπλωματικές Εργασίες στο εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας

Το Εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας του Τμήματος ΒΕΤ (ακαδημαϊκός υπεύθυνος Β. Δουρής) προτίθεται να καλύψει τα παρακάτω θέματα πειραματικών διπλωματικών εργασιών για την ακαδημαϊκή περίοδο 2025-26:

#	Θέμα	Συνεργασία	Περιοχή
1	Χαρτογράφηση μεταθετών στοιχείων σε γονιδιώματα λεπιδοπτέρων εντόμων	Χ. Νικολάου (lab link)	ΕΚΕΒΕ Αλ. Φλέμιγκ, Βάρη Αττικής
2	Έκφραση και λειτουργική ανάλυση χημειοαισθητηριακών πρωτεϊνών εντόμων ως προς ικανότητα δέσμευσης εντομοκτόνων		Τμήμα ΒΕΤ και ΙΒΕ/ΙΤΕ, Ιωάννινα
3	Έλεγχος τοξικότητας εντομοκτόνων σε διαγονιδιακές μύγες Δροσόφιλα που εκφράζουν χημειοαισθητηριακές πρωτεΐνες [πιθανότερη έναρξη Φεβρουάριος 2026]		Τμήμα ΒΕΤ και ΙΒΕ/ΙΤΕ, Ιωάννινα

 

Το θέμα #1 αφορά υπολογιστική γονιδιωματική-βιοπληροφορική, και θα πραγματοποιηθεί σε συνεργασία με το εργαστήριο του Χριστόφορου Νικολάου, ερευνητή στο Ερευνητικό Κέντρο Βιοϊατρικών Επιστημών “Αλέξανδρος Φλέμιγκ” στη Βάρη Αττικής) (https://www.fleming.gr/research/ibi/cnikolaou-lab). Προϋποθέτει κάποια ελάχιστη εξοικείωση με υπολογιστές (Linux) και στοιχειώδη ικανότητα  προγραμματισμού. Η διπλωματική περιλαμβάνει αναλύσεις συγκριτικής γονιδιωματικής για την εύρεση επαναλήψεων / μεταθετών στοιχείων σε γονιδιωματικές περιοχές που περιβάλλουν ρυθμιστικές αλληλουχίες γονιδίων που σχετίζονται με αναπτυξιακές διαδικασίες στα λεπιδόπτερα έντομα. Είναι γενικά προτιμητέο οι ενδιαφερόμενοι/ες να είναι σε θέση να περάσουν εκτεταμένα διαστήματα στην Αττική.

Το θέμα #2 θα πραγματοποιηθεί στο ΤΒΕΤ (και το ΙΒΕ/ΙΤΕ) και αφορά την έκφραση σε συστήματα βακτηρίων ή κυττάρων εντόμων (εφόσον είναι λειτουργική η σχετική υποδομή στο εργαστήριο) υποψήφιων πρωτεϊνών CSP (chemosensory proteins) λεπιδοπτέρων και στη συνέχεια τον λειτουργικό χαρακτηρισμό τους ως προς την ικανότητα δέσμευσης εντομοκτόνων με βιοχημικές και βιοφυσικές τεχνικές (φθορισμομετρία, θερμοφόρηση μικροκλίμακας).

Το θέμα #3 θα πραγματοποιηθεί στο ΤΒΕΤ (και το ΙΒΕ/ΙΤΕ) εφόσον έχουν εγκατασταθεί στο εργαστήριο οι απαιτούμενες υποδομές στο μεταξύ (γι’ αυτό δίνεται ως πιθανότερη ημερομηνία έναρξης το θερινό εξάμηνο) και αφορά την παραγωγή δεδομένων από βιοδοκιμές τοξικότητας σε διαγονιδιακές μύγες Δροσόφιλα που εκφράζουν  CSP (chemosensory proteins) λεπιδοπτέρων εντόμων σε συνδυασμό με βασικούς μηχανισμούς αποτοξικοποίησης.

Σχετικά με τον πιθανό ρόλο των χημειοαισθητηριακών πρωτεϊνών στην ανθεκτικότητα σε εντομοκτόνα οι ενδιαφερόμενες/οι μπορούν να ανατρέξουν σε πρόσφατο άρθρο ανασκόπησης του εργαστηρίου https://www.mdpi.com/2075-4450/16/5/496

Το εργαστήριο μπορεί να υποστηρίξει και βιβλιογραφικές διπλωματικές εργασίες εφόσον υπάρξει ενδιαφέρον.

Προϋπόθεση για να επιλεγεί κάποιος για τις συγκεκριμένες διπλωματικές είναι κατά την έναρξη της εργασίας (Οκτώβριος 2025 ή Φεβρουάριος 2026) να έχει συμπληρώσει τον απαιτούμενο αριθμό διδακτικών μονάδων / ECTS όπως προβλέπεται από τον κανονισμό του Τμήματος. Είναι επιθυμητό (αν και όχι απαραίτητο) οι ενδιαφερόμενοι/ες να έχουν εξεταστεί με επιτυχία στα υποχρεωτικά μαθήματα Μοριακή Βιολογία και Μοριακή Γενετική και καλό θα είναι να έχουν επιλέξει και παρακολουθήσει το μάθημα επιλογής Γενετική Μηχανική (Θεωρία).

Για ερωτήσεις, διευκρινίσεις, πληροφορίες και προγραμματισμό αναλυτικής συζήτησης, οι τυχόν ενδιαφερόμενοι φοιτητές/τριες μπορούν να επικοινωνούν με τον ακαδημαϊκό υπεύθυνο του Εργαστηρίου (vdouris@uoi.gr) κατά προτίμηση μέχρι τέλος Μαΐου 2025. Όσοι/ες έχουν ήδη επικοινωνήσει και εξακολουθούν να ενδιαφέρονται, μπορούν να ζητήσουν να προγραμματιστεί κάποια συνάντηση δια ζώσης με τον υπεύθυνο και τα μέλη του εργαστηρίου.