Untitled Document

[BEY804] Βιοπληροφορική

  • Υποχρεωτικό μάθημα

Διδάσκοντες: Κ. Παπαλουκάς

  • Διδακτικές μονάδες: 6
  • ECTS: 7
  • Θεωρία: 3 ώρες/εβδομάδα
  • Εργαστήριο: 3 ώρες/εβδομάδα

Περιγραφή μαθήματος



Υπολογιστικές Προσεγγίσεις σε Βιολογικές Διαδικασίες:

  • Κυτταρικές Δομές
  • Αποκωδικοποίηση Γονιδιώματος και Συστημική Ανάλυση
  • Γονιδιακή Ρύθμιση
  • Φυλογένεση
  • Κλινικές και Βιολογικές Βάσεις Δεδομένων

Υπολογιστικές Εφαρμογές:

  • Διαχείριση και Ανάλυση Γενετικής Πληροφορίας
  • Στοίχιση Ακολουθιών
  • Διαχείριση και Ανάλυση Πρωτεϊνικής Πληροφορίας
  • Κατασκευή Φυλογενετικών Δένδρων
  • Ανάλυση Μικροσυστοιχιών – Δίκτυα Γονιδίων

Υπολογιστικά Εργαλεία:

  • Πιθανοκρατικό Πλαίσιο
  • Κρυμμένα Μοντέλα Markov
  • Τεχνητά Νευρωνικά Δίκτυα
  • Γενετικοί Αλγόριθμοι

Εργαστηριακές Ασκήσεις

  1. Βιολογικές Βάσεις Δεδομένων: Σχεδιασμός και Διαχείριση
  2. Πρωτεϊνικές Βάσεις Δεδομένων: Αναζήτηση, Διαχείριση και Ανάλυση
  3. Βάσεις Δεδομένων DNA
  4. Ανάλυση Ακολουθιών DNA
  5. Ανάλυση Πρωτεϊνικών Ακολουθιών
  6. Ομολογιακή Ανάλυση Βιολογικών Ακολουθιών
  7. Πολλαπλή Στοίχιση Ακολουθιών
  8. Επεξεργασία και Ανάλυση Πρωτεϊνικών Δομών
  9. Επεξεργασία και Ανάλυση RNA
  10. Κατασκευή Φυλογενετικών Δένδρων

Οι εργαστηριακές ασκήσεις συμμετέχουν με ποσοστό 30% στο συνολικό βαθμό του μαθήματος. Ο εργαστηριακός βαθμός προκύπτει από την αξιολόγηση των εργασιών που μοιράζονται κατά τη διάρκεια των εργαστηριακών ασκήσεων. Το εργαστήριο θεωρείται ολοκληρωμένο μόνο μετά την παράδοση και των σχετικών εργασιών.