Untitled Document

[ΒΕΕ713] Μοριακή Οικολογία και Γενετική της Διατήρησης

  • Μάθημα επιλογής

Διδάσκοντες: Κ. Σωτηρόπουλος

  • Διδακτικές μονάδες: 5
  • ECTS: 5
  • Θεωρία: 2 ώρες/εβδομάδα
  • Εργαστήριο: 3 ώρες/εβδομάδα

Περιγραφή μαθήματος


  1. Η μοριακή βιολογία και η γενετική στην εξελικτική οικολογία – Ιστορική αναδρομή – Μοριακές τεχνικές στην οικολογία – Σύγχρονες τάσεις
  2. Μοριακοί δείκτες – χαρακτηριστικά, ιδιότητες, εφαρμογές
  3. Γενετική ανάλυση πληθυσμών – Ανάλυση ενός πληθυσμού – Δείκτες γενετικής ποικιλότητας – Δραστικό μέγεθος πληθυσμού
  4. Παράγοντες που επηρεάζουν τη γενετική ποικιλότητα – Φυσική επιλογή – Γενετική παρέκκλιση – Στενωποί – Αναπαραγωγικά συστήματα
  5. Ποικιλότητα μεταξύ των πληθυσμών – Πληθυσμιακή υποδιαίρεση – Συντελεστές F – Γονιδιακή ροή – Απομόνωση λόγω απόστασης
  6. Τοπιακή γενετική – Επίδραση των χαρακτηριστικών του τοπίου στη δομή και οργάνωση της γενετικής ποικιλότητας – Φράγματα στη γονιδιακή ροή – Κατακερματισμός – Μεταπληθυσμοί
  7. Ενδο-ειδικές φυλογένειες – Φυλογεωγραφία – Μοριακοί δείκτες στη φυλογεωγραφία – Μοριακά ρολόγια – Φυλογενετικά δέντρα – Συγκριτική και εφαρμοσμένη φυλογεωγραφία
  8. Γενετική της διατήρησης – Περιγραφή και οργάνωση της γενετικής ποικιλότητας – Απώλεια της γενετικής ποικιλότητας στους μικρούς πληθυσμούς – Ενδογαμία – Γενετικά βιώσιμοι πληθυσμοί – Καθορισμός διαχειριστικών μονάδων – Γενετική διαχείριση άγριων πληθυσμών – Επανεισαγωγές – Γενετική διαχείριση ειδών και πληθυσμών σε αιχμαλωσία – Γενετική των απειλούμενων και των εισβλητικών ειδών
  9. H Γενωμική στην οικολογία και στη διατήρηση (ecological genomics - conservation genomics) – Προσαρμοστική γενετική ποικιλότητα

Εργαστηριακές Ασκήσεις

  1. Αλληλουχίες DNA – Έλεγχος – Στοίχιση – Βάσεις δεδομένων – GenBank
  2. Γονοτύπιση – Καταγραφή γονοτύπων από μικροδορυφορικά δεδομένα
  3. Περιγραφή και οργάνωση της γενετικής ποικιλότητας – Ανάλυση πληθυσμιακών δεδομένων
  4. Γενετική διάρθρωση πληθυσμών – Εκτίμηση πρόσφατης γονιδιακής ροής και ρυθμού μετανάστευσης
  5. Διερεύνηση εξελικτικών σχέσεων – Φυλογενετική ανάλυση αλληλουχιών mtDNA
  6. Ταυτοποίηση και χαρακτηρισμός άγνωστων δειγμάτων
  7. Γενετική της Διατήρησης – Μετεγκαταστάσεις σε ζωικούς πληθυσμούς
  8. Εκτίμηση πληθυσμιακού μεγέθους με τη χρήση γενετικών δεδομένων
  9. Μελέτη υποδειγματικών περιπτώσεων – Pαρουσίαση άρθρων με τη μορφή σεμιναρίων από τους φοιτητές

Οι εργαστηριακές ασκήσεις αφορούν στην ανάλυση γενετικών δεδομένων με τη χρήση των προγραμμάτων MEGA 5.0 (Tamura et al, 2011), GenAlEx 6 (Peakall & Smouse, 2006) και STRUCTURE 2.3 (Pritchard, Wen & Falush, 2009), και διεξάγονται στην αίθουσα Η/Υ.