Untitled Document

[ΒΕΕ905] Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής

  • Μάθημα επιλογής

Διδάσκοντες: Κ. Παπαλουκάς

  • Διδακτικές μονάδες: 4
  • ECTS: 4
  • Θεωρία: 2 ώρες/εβδομάδα
  • Εργαστήριο: 2 ώρες/εβδομάδα

Περιγραφή μαθήματος


  1. Δομές και Εντολές της Γλώσσας Perl
  2. Διαδικασίες και Λειτουργίες
  3. Κανονικές Εκφράσεις
  4. Δυναμική Διαχείριση Μνήμης
  5. Ροή Δεδομένων
  6. Ανάπτυξη Προγραμμάτων
  7. Perl και Βιοπληροφορική
  8. Σύνθετες Δομές Δεδομένων
  9. Αντικειμενοστραφής Προγραμματισμός
  10. Μικροσυστοιχίες και XML
  11. Γραφικά και CGI
  12. Συνεργασία με το Διαδίκτυο
  13. Δίκτυα Μοντελοποίησης
  14. Η/Υ DNA

Εργαστηριακές Ασκήσεις

  1. Είσοδος και Έξοδος Δεδομένων στην Perl
  2. Αναπαράσταση και Επεξεργασία Βιολογικών Δεδομένων
  3. Γενετικός Κώδικας
  4. Συνεργασία με Βιολογικές Βάσεις Δεδομένων
  5. Χρήση Bioperl
  6. Υλοποίηση Αλγορίθμου Στοίχισης Ακολουθιών
  7. Υλοποίηση Φυλογενετικής Ανάλυσης

Οι εργαστηριακές ασκήσεις συμμετέχουν με ποσοστό 50% στο συνολικό βαθμό του μαθήματος. Ο εργαστηριακός βαθμός προκύπτει από την αξιολόγηση των εργασιών που μοιράζονται κατά τη διάρκεια των εργαστηριακών ασκήσεων. Το εργαστήριο θεωρείται ολοκληρωμένο μόνο μετά την παράδοση και των σχετικών εργασιών.